創新是深圳發展的靈魂。由于科技基礎先天不足，深圳的高校與科研院所數量不多，與迅猛的經濟增長難以匹配。不過，深圳華大基因、光啟研究院、中國科學院深圳先進技術研究院、深圳清華大學研究院等新型研究機構，在源頭創新與產業發展上走出了別具特色的新路子。
與傳統的研究機構不同，近年在深圳誕生或“移師”至此的機構，將創新與產業化緊密結合，一些技術已處于世界前沿，成為我國科技創新和產業化中令人矚目的新生力量。
“四不像”研究機構的內生動力
在深圳，有一些特別的機構，既像研究機構、學校，又像企業，深圳清華大學研究院就是一個典型的例子。
1996年以來，深圳清華大學研究院把事業單位、高校、企業、科研機構四者的優勢相結合，創新科技成果轉化新方式，創造出產學研融合新模式，即以企業為主體，以市場為導向，“深加工”高科技成果，成為市場風向的“守望人”、企業的“孵化器”、科研機構的“供血者”。
深圳清華大學研究院開創了一個“四不像”模式。第一，是企業又不完全像企業。研究院實行企業化管理，但不同于一般企業，是科技創新和成果轉化基地，強調社會效益和經濟效益并重。第二，是事業單位又不完全像事業單位，實行事業單位的企業化運作。第三，是研究機構又不完全像科研院所，將科技創新、人才培養、管理服務和創業投資等功能融為一體。第四，是大學又不完全像大學，植根于清華大學的校風和傳統，融入了特區企業文化的特色。
這個模式讓深圳清華大學研究院擺脫了“政府是投入主體，領導是基本觀眾，得獎是主要目的，倉庫是最終歸宿”的模式，扮演了促成科研成果產業化的“紅娘”，給有創業沖動、想發掘金礦的企業遞上一把高科技的“鐵鍬”。通過技術入股等方式，深圳清華大學研究院實現了社會效益和經濟效益的統一，形成了“科研創造價值、價值反哺科研”的良性循環，為研究院自我發展提供不竭的“內生動力”。
2010年揭牌成立的光啟高等理工研究院是另一個特別的例子。這個由政府、產業界和金融界共同支持的科研機構，吸引了來自多個國家和地區的科學家，兩年來大規模地覆蓋底層核心知識產權，奠定了在超材料設計領域的全球領先地位。
今年7月，全球首條超材料生產線——深圳光啟超材料生產線在龍崗區正式投產，標志著超材料這一新興領域正式從實驗室走向了生產線。廣東科技廳廳長李興華曾表示，廣東要想做大做強新材料產業，就需要更多可以在源頭創新的“光啟”。
新型研究機構吹響產業“集結號”
2011年，深圳市低成本健康產學研資聯盟、深圳市機器人產學研資聯盟、深圳基因產學研資聯盟、深圳超材料產業聯盟等陸續揭牌成立，中國科學院深圳先進技術研究院、華大基因、光啟研究院等在其中發揮著重要的作用。
深圳基因產學研資聯盟理事長、華大基因研究院院長汪建去年表示，期望深圳基因產學研資聯盟未來5至10年能達到千億元產值。
光啟研究院則發起設立了“超材料產業基金”，專注投資超材料領域新興創業企業，并用于扶持超材料產業聯盟上下游企業，進而實現以超材料為核心驅動力的超材料產業聯盟做大做強。
中國科學院深圳先進技術研究院則是低成本健康、機器人方面的“領頭人”，這個最早只有5人的團隊如今已發展至千余人的規模。
據深圳先進技術研究院院長樊建平介紹，該院在重視孵化企業的同時，強調產業鏈的培育，積極營造健康有序的產業生態。該院牽頭成立的深圳市低成本健康聯盟孵化企業已形成超過40個產品服務的產業群，機器人聯盟中僅機器人協會的企業產值總計達160億元人民幣，出口產值達90億，企業從業人員5萬人。
這些新型研究機構的發展，讓深圳增加了更多創新的“搖籃”。去年，科技部同意依托光啟高等理工研究院組建超材料電池調制技術國家重點實驗室，依托華大基因研究院組建農業基因組學國家重點實驗室，至此，深圳的企業國家重點實驗室增至4家。2011年內，深圳新建27家重點實驗室，全市的存量規模上升到120多家，初步形成一個根深葉茂的源頭創新群落，大大提升深圳基礎研究和科技創新能力。
加強高校研究機構建設，增強源頭創新
2011年深圳GDP突破1.1萬億元，經濟增長愈加依靠創新驅動，實現高新技術產品產值1.1萬億元，其中60%具有自主知識產權。2011年全社會研發投入約430億元，占GDP比重達3.66%，是全國平均水平的兩倍。
在上述新興載體成為深圳創新“原動力”的同時，深圳仍然咬定源頭創新不放松，加強高水平的高等院校、研究機構和重點實驗室的建設。今年的市政府工作報告提出，要爭取更多的國家重大科技基礎設施布局深圳，加快建設國家基因庫，發揮國家超級計算深圳中心等重大科技基礎設施的支撐和服務作用。繼續加強創新載體建設，新增各級重點實驗室、工程實驗室、工程研究中心和企業技術中心100家以上。組織實施50項重大技術攻關項目，引導科研機構、企業積極承擔和參與國家科技重大專項，力爭在一些前沿和新興領域取得突破。
去年以來，深圳計劃創辦10所國際化專業特色學院，華大基因學院、深圳先進技術學院陸續揭牌成立，多所特色學院正在積極籌建中。按照設想，特色學院建設按照“小而精、開放式、國際化”原則，通過積極探索高校、科研機構、企業協同創新的新模式，大力培養深圳戰略性新興產業發展所急需的高層次創新型人才。
